Se lesionó el 5 de mayo de 2016, en la semifinal de la Europa League ante el Shakhtar Donetsk, y no volvió a ponerse la camiseta del Sevilla FC, pese a que tenía por delante más de un año firmado con el club nervionense. Benoît Trémoulinas (32) sufrió una rotura del menisco interno de la rodilla izquierda, y el primer parte médico del club reflejaba que iba a estar cuatro semanas de baja. Trémoulinas espera ahora que alguien le dé una oportunidad para demostrar que está recuperado. De momento, se está entrenando con los reservas del Girondins.
